نینجاها بایستی ۱۸ مهارت مختلف را کسب کنند که در طومارهای «توگاکوره ریو» نخستین مدرسه نینجوتسو فهرست شده‌است:

سئی شین تکی کیویو – SeiShin Teki Kyoyo – فرهنگ یا پالایش روحی – 教養

تای جوتسو – Tai Jutsu – مبارزه بدون سلاح – 体術

نینجاتو – Ninjato – مبارزه با شمشیر – 忍者剣

بوجوتسو – Bo Jutsu – مبارزه با چوب – 棒術

شورایکن جوتسو – Shouriken Jutsu – هنر استفاده از ستاره نینجا – 手裏剣

سو جوتسو – So Jutsu – مبارزه با نیزه – 槍術

ناگی ناتا جوتسو –

Ninjato

– مبارزه با تبرزین – 長刀術 یا 薙刀術

کوساری کاما جوتسو – KusariGama Jutsu – داس و زنجیر – 鎖鎌

کایاکو جوتسو – Kayaku Jutsu – هنر آتش و انفجار – 火薬術

هن سو جوتسو – Henso Jutsu – هنر تغییر چهره و جعل هویت – 変装術

شینوبی ایری – Shinubi Iri – ورود مخفیانه به اماکن

با جوتسو – Ba Jutsu – هنر سوارکاری

سوئی رن جوتسو – Sui Ren jutsu – تمرینات در آب – 水練

بوری یاکو – Boryaku – تاکتیک و استراتژی – 謀略

چوهو – Choho – جاسوسی و کسب اطلاع – 諜報

این تون جوتسو – Inton Jutsu – هنر فرار و مخفی شدن –

تن من- Ten mon – شناخت وضعیت آب و هوا – 天門

چی مون – chi mon – جغرافیا و جهت شناسی – 地門